Repoveden luontoa leimaa jylhät maisemat, jotka ovat saaneet alkunsa jääkauden ajoilta.
Alueen luonto on hyvin monimuotoista. Alueen näyttävimmät kalliot ovat jykevää graniittia mutta etenkin Lapinsalmen läheltä löytyy haurasta rapakiveä. Metsistä löytyy satavuotiaita ikihonkia sekä naavakuusia mutta toisissa paikoissa alueen metsätalouskäytön jäljet ovat edelleen selkeästi havaittavissa. Repoveden eläimistä tunnetuin on varmasti kaakkuri, joka pesii Repoveden pienissä lammissa. Repovedellä, etenkin alueen pohjoisosissa asuu pohjoisen havumetsävyöhykkeen peruseläimiä kuten hirviä, kettuja, ilveksiä, korppeja ja metsäkanalintuja.